实验, 建模, 基因组学方法研究和表征与食源性病原体相关的风险

加入食品科学与营养学系 研讨会系列 活动的主讲嘉宾是陈瑞希博士.D. 康奈尔大学魏德曼实验室的候选人.

据估计，大约有9.在美国，每年有400万例由已知病原体引起的国内获得性食源性疾病. 在食源性病原体中, 非伤寒沙门氏菌(NTS)和单核细胞增生李斯特菌(LM)引起了公众的极大关注. 据估计，11%的疾病是由NTS引起的, 35%的住院率, 28%的死亡率, 使其成为美国食源性疾病和死亡的主要原因. 虽然LM并不是食源性疾病的最大份额, 它是食源性死亡的第三大原因，死亡率高达16%，主要针对胎儿, 老年人, 免疫系统受损的个体. 因此, 不断改进控制战略和监管政策，以降低食品供应中与这两种病原体相关的风险，这一点至关重要.

烟熏海鲜是一种即食产品，LM污染的发生率很高，并与多次召回有关. Chen和他的同事使用冷熏鲑鱼作为模型(i)调查导致LM污染风险增加的因素，(ii)开发二阶蒙特卡罗模型框架来评估与产品相关的企业风险，并指导行业实践以降低此类风险. 另一方面, 据报道，NTS血清型和相关亚型在人类毒力方面存在差异. 目前的NTS控制策略可能无意中侧重于源人群中高患病率的血清型和亚型，但很少与人类临床疾病相关, 而目前还没有一种合理和可扩展的方法来确定具有不同能力的NTS引起人类疾病. 研究人员开发并实施了一个利用WGS数据和NCBI病原体检测数据库中的相关元数据的框架，以确定(i)引起人类疾病的不同可能性的亚型和(ii)导致这种差异的基因组特征. 所产生的数据最终可用于预测和量化潜在的毒力，以便采用基于风险的方法来控制与主要农业动物相关的各种NTS血清型.

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